Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx41Q91VN6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx41Q91VN6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms