Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep57l1Q8VDS7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cep57l1Q8VDS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms