Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GcaQ8VC88 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcaQ8VC88 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms