Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DTX3LQ8TDB6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3LQ8TDB6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms