Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk8Q8R3L8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms