Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE23Q8NDY6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE23Q8NDY6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms