Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C17orf53Q8N3J3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf53Q8N3J3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf53Q8N3J3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms