Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rassf9Q8K342 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rassf9Q8K342 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms