Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hacd3Q8K2C9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hacd3Q8K2C9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hacd3Q8K2C9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms