Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1eQ8K202 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1eQ8K202 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1eQ8K202 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms