Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrit1Q8K099 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrit1Q8K099 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrit1Q8K099 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms