Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh2d5Q8JZW5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh2d5Q8JZW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d5Q8JZW5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d5Q8JZW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms