Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS3Q8IXF0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS3Q8IXF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms