Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCUBE3Q8IX30 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCUBE3Q8IX30 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms