Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp27Q8CEG8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Usp27Q8CEG8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Usp27Q8CEG8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Usp27Q8CEG8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Usp27Q8CEG8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp27Q8CEG8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp27Q8CEG8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp27Q8CEG8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Usp27Q8CEG8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Usp27Q8CEG8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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