Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
E4f1Q8CCE9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E4f1Q8CCE9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E4f1Q8CCE9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms