Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc15Q8C9M2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc15Q8C9M2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms