Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Grik4Q8BMF5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grik4Q8BMF5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms