Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg4dQ8BGV9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg4dQ8BGV9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms