Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.6Q85ZW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms