Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim17Q7TPM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms