Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf139Q7TMV1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf139Q7TMV1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms