Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP27Q6ZUM4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGAP27Q6ZUM4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms