Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
LRRC9Q6ZRR7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LRRC9Q6ZRR7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms