Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cand1Q6ZQ38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cand1Q6ZQ38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cand1Q6ZQ38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms