Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPTNQ6XPR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPTNQ6XPR3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 951.5 ms