Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRSAM1Q6UWE0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms