Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbtb40Q6PCS8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zbtb40Q6PCS8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zbtb40Q6PCS8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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