Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr44Q6NVE8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr44Q6NVE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr44Q6NVE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms