Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx11Q6AXC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx11Q6AXC6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms