Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rftn1Q6A0D4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms