Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nlrp4eQ66X19 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp4eQ66X19 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms