Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.2 ms