Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim25Q61510 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms