Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3Q60803 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf3Q60803 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms