Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF38BQ5VTL8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38BQ5VTL8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms