Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53rkaQ5U452 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53rkaQ5U452 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53rkaQ5U452 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trp53rkaQ5U452 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trp53rkaQ5U452 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms