Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBAP2Q5T6F2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms