Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psme4Q5SSW2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Psme4Q5SSW2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms