Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms