Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim7Q5RKS2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim7Q5RKS2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms