Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a5Q5RJI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a5Q5RJI2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a5Q5RJI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc44a5Q5RJI2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc44a5Q5RJI2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms