Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRT3Q5FWE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms