Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
L1td1Q587J6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1td1Q587J6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1td1Q587J6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms