Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms