Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf38aQ4FK66 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms