Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Carmil2Q3V3V9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms