Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacs2Q3V3Q7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pacs2Q3V3Q7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pacs2Q3V3Q7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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