Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uspl1Q3ULM6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uspl1Q3ULM6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uspl1Q3ULM6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Uspl1Q3ULM6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Uspl1Q3ULM6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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