Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ulk3Q3U3Q1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk3Q3U3Q1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms